Grunnskole barn og ungdom har en assisterende rektor, fire avdelingsledere og to rådgivere.
Assisterende rektor har det øverste faglige og personalmessige ansvaret for avdelingen.
Avdelingsledere har ansvar for hver sin avdeling og skal følge opp lærernes arbeid og ivareta og tilrettelegge for lærernes arbeid både utenfor og inne på Johannes læringssenter.